Василий Васильевич Щербаков родился 20 апреля 1951 года в деревне Казимирово Полоцкого района Витебской области в крестьянской семье. Окончил 10 классов Новополоцкой средней школы. Работал слесарем-монтажником и одновременно учился в витебском авиационном центре ДОСААФ.
С 1969 года служил в Советской Армии. Учился в Аткарском УАЦ ДОСААФ. В 1970 году, получив воинское звание младшего лейтенанта, был зачислен в кадры ВВС и начал службу в вертолётной авиации. В 1972 год экстерном сдал экзамены за полный курс Сызранского высшего военного авиационного училища лётчиков имени 60-летия СССР. С 1973 по 1977 год неоднократно участвовал в поиске и эвакуации космических объектов и экипажей космических кораблей.
Находясь в составе ограниченного контингента Советских войск в Афганистане, командовал вертолётной эскадрильей. Совершил 318 боевых вылетов. Как командир эскадрильи прославился, когда во время боя с душманами в 1979 год был сбит советский вертолет, В. В. Щербаков подобрал его экипаж и на своей подбитой машине вывез с поля боя.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 28 апреля 1980 года за мужество и героизм, проявленные при оказании интернациональной помощи Демократической Республике Афганистан, майору Василию Щербакову присвоено звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая звезда».
Полковник В. В. Щербаков был командиром вертолётной эскадрильи вертолётного полка в составе 40-й армии Краснознаменного Туркестанского военного округа (ограниченный контингент Советских войск в Демократической Республике Афганистан). После войны в Афганистане служил на различных командных должностях. Офицерский путь закончил в должности начальника управления авиации 7-й танковой армии в звании полковника. В 1984 году с отличием окончил Военно-воздушную академию имени Ю. А. Гагарина. Награжден орденом Ленина, орденом «За службу Родине в Вооружённых Силах СССР» II и III степеней, медалями.
В 1993–1994 и с 1995 года был заместителем председателя Белорусского союза ветеранов войны в Афганистане. В 1994–1995 годах – заместителем председателя Комитета по социальной защите военнослужащих, лиц рядового и начальствующего состава внутренних дел, воинов-интернационалистов, уволенных в запас (отставку), и членов их семей при Совете Министров Республике Беларусь. В последние годы жил в Смоленске, возглавлял благотворительный фонд «Память».
28 июня 2010 года сердце замечательного человека, патриота, Героя-интернационалиста, уроженца Полоцкого района Василия Васильевича Щербакова на 60-м году жизни остановилось. Похоронен в г. Минске.
15 февраля 2012 года состоялось открытие мемориальной доски Герою Советского Союза полковнику Василию Щербакову. Памятный знак установлен на здании средней школы № 3 г. Новополоцка, которую окончил Василий Васильевич.
